Phòng Quản lý tổng hợp trực thuộc Viện Hải dương học có chức năng tham mưu và giúp Viện trưởng Viện Hải dương học quản lý, phát triển và tổ chức thực hiện các hoạt động của Viện, bao gồm: công tác tổ chức – cán bộ và kiểm tra, quản lý khoa học, đào tạo, hợp tác quốc tế, tài chính, xây dựng cơ bản, quản trị hành chính và các hoạt động khác.