Phòng Động vật biển thực hiện chức năng điều tra, nghiên cứu cơ bản về động vật thủy sinh và các hệ sinh thái biển; quan trắc, dự báo và phục hồi nguồn lợi và các hệ sinh thái biển.

Có nhiệm vụ:

1. Điều tra, nghiên cứu cơ bản về động vật thủy sinh.
2. Nghiên cứu sinh học, sinh thái, biến động và dự báo nguồn lợi động vật thủy sinh; động vật quý hiếm nhằm quản lý và phát triển bền vững tài nguyên.
3. Nghiên cứu đặc trưng các hệ sinh thái biển và cơ sở khoa học cho bảo tồn thiên nhiên biển.
4. Quan trắc các hệ sinh thái biển, nguồn lợi động vật thủy sinh; động vật quý hiếm nhằm đánh giá sự thay đổi, dự báo và quản lý thích ứng.
5. Phục hồi nguồn lợi động vật thủy sinh và rạn san hô.
6. Thực hiện các nhiệm vụ khác theo sự phân công của Viện trưởng.

Phòng Động vật biển gồm 10 cán bộ khoa học, trong đó:

• 02 Tiến sỹ
• 06 Thạc sỹ
• 02 Cử nhân