Trạm quan trắc và phân tích môi trường biển Nha Trang được thành lập theo quyết định số : 1286/KHCNQG-QD ngày 29 tháng 6 năm 1996 của Giám đốc trung tâm khoa học tự nhiên và Công nghệ Quốc gia, có chức năng:

• Thức hiện quan trắc các thông số môi trường biển.
• Cung cấp các thông tin về các chỉ tiêu chất lượng, hiện trạng môi trường.
• Tham gia nghiên cứu, đề xuất các phương án và giải pháp xử lý ô nhiễm môi trường.
• Đào tạo và bồi dưỡng nghiệp vụ cho cán bộ quan trắc, kiểm nghiệm môi trường biển theo yêu cầu công tác quản lý và bảo vệ môi trường ở Trung ương và địa phương.